Mùa Hè vừa qua, HLV Jose Mourinho đã đưa về trung vệ Eric Bailly từ Villarreal. Sự có mặt của bản hợp đồng trị giá 30 triệu bảng khiến tương lai của trung vệ Phil Jones bị nghi ngờ. Mùa trước, anh chỉ ra sân có 13 lần tại Premier League vì những chấn thương. Khi cầu thủ sinh năm 1992 vắng mặt, Blind đã cùng với Smalling chơi rất tốt ở hàng thủ. Jones đã cố gắng tập luyện để lấy lại vị trí ở mùa giải này, nhưng anh vẫn chưa được trao cơ hội vì Mourinho đang đặt niềm tin vào Blind và Bailly.

Trong những trận đấu đầu tiên ở mùa giải 2016/17, HLV Mourinho thường xuyên sử dụng bộ đôi trung vệ Bailly và Blind. Trong hai trận gần nhất ông chuyển sang dùng Smalling và Bailly. Jones vẫn chưa đá một trận nào ở mùa giải này. Anh giờ là lựa chọn thứ 4 ở vị trí trung vệ. Mới nhất, cầu thủ 24 tuổi tiếp tục dính chấn thương. Cụ thể, Phil Jones dính chấn thương dây chằng đầu gối, nhưng anh có thể trở lại vào tháng 10 tới đây.