Hoà 1-1 sau 90 phút thi đấu chính thức, hai đội U17 HAGL và SHB Đà Nẵng cùng bước vào loạt đá luân lưu đầy may rủi để xác định đại diện vào bán kết. Sau 5 loạt đá, U17 HAGL đã vượt qua đối thủ với tỷ số 5-4 để vào bán kết. 


 

Tại bán kết, U17 HAGL sẽ chạm trán U17 PVF. Ở trận đấu sau đó, U17 PVF đã vượt qua U17 Becamex Bình Dương với tỉ số 3-1.
 

Trận bán kết còn lại là màn chạm trán giữa U17 Hà Nội và U17 Viettel – tuyến trẻ của á quân và nhà ĐKVĐ V-League 2020. 
 

U17 Hà Nội đã vượt qua U17 học viện Nutifood với tỉ số 3-1. Trong khi đó, U17 Viettel giành chiến thắng 2-0 trước U17 Hallmen TP Hồ Chí Minh.