Bernardo Silva gia nhập lò đào tạo trẻ của Benfica khi mới 7 tuổi và đã vượt qua mọi cấp độ trước khi đặt chân lên đội một ở tuổi 19. Tuy nhiên, ngôi sao người Bồ chỉ ra sân được 3 lần cho Benfica ở mùa giải 2013/14. Anh không được chơi nhiều hơn 15 phút trong bất kỳ trận nào và chỉ có 1 lần ra sân ở Primeira Liga.

Sau đó, Silva bị đẩy đến Monaco theo dạng cho mượn và được mua đứt. Man City chiêu mộ anh vào năm 2017. Tại sân Etihad, Bernardo đã tỏa sáng rực rỡ trong đội hình của Pep Guardiola. Và mới đây, cầu thủ 25 tuổi đã lên tiếng bày tỏ khát khao được trở lại Benfica trong tương lai.