Giai đoạn cuối mùa giải này, M.U có trong tay song song hai lựa chọn giành vé dự Champions League mùa tới. Một là Top 4 Premier League và hai là vô địch Europa League. Mourinho cảm thấy con đường ở cúp châu Âu ngắn hơn và dễ dàng hơn, và thế là ông buông mặt trận giải Ngoại hạng Anh. Trong những vòng đấu cuối ở đấu trường quốc nội, vị chiến lược gia người Bồ chỉ sử dụng đội hình dự bị. Ông đã cho các trụ cột tập trung hoàn toàn vào đấu trường Europa League.

M.U đã đánh bại Celta Vigo để giành quyền vào chơi trận chung kết Europa League. Đối thủ của họ là Ajax, đội đã đánh bại Lyon 5-4 sau hai lượt trận. Sáng nay, trận đấu cuối cùng ở đấu trường hạng 2 bóng đá châu Âu đã diễn ra. M.U với kinh nghiệm và sự vượt trội về đẳng cấp đã nắm hoàn toàn thế chủ động. Mourinho biết cách làm thế nào để lái trận đấu theo ý mình. M.U đã không quá khó khăn để đánh bại đối thủ với tỉ số 2-0. Với kết quả này, đội chủ sân Old Trafford lần đầu tiên vô địch Europa League, cùng với đó là tấm vé vào thẳng vòng bảng Champions League mùa tới.